Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps8Q0P5W1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms