Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms