Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms