Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sox10Q04888 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sox10Q04888 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox10Q04888 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms