Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NfiaQ02780 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NfiaQ02780 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NfiaQ02780 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NfiaQ02780 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NfiaQ02780 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NfiaQ02780 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NfiaQ02780 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NfiaQ02780 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NfiaQ02780 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NfiaQ02780 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NfiaQ02780 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NfiaQ02780 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms