Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb4Q02738 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms