Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
GscQ02591 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GscQ02591 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GscQ02591 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms