Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme2Q01768 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme2Q01768 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms