Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms