Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms