Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Itga4Q00651 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms