Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme1P97371 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms