Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmsP97355 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmsP97355 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmsP97355 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmsP97355 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmsP97355 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SmsP97355 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SmsP97355 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms