Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cux2P70298 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cux2P70298 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms