Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Snrpd3P62320 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms