Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nphp4P59240 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms