Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paxbp1P58501 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms