Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samsn1P57725 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samsn1P57725 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Samsn1P57725 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samsn1P57725 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samsn1P57725 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samsn1P57725 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Samsn1P57725 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Samsn1P57725 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms