Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TdgP56581 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TdgP56581 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TdgP56581 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TdgP56581 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TdgP56581 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TdgP56581 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TdgP56581 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TdgP56581 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TdgP56581 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms