Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PctpP53808 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PctpP53808 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms