Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2e3P52483 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms