Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TspoP50637 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TspoP50637 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms