Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nedd4P46935 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms