Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rab11bP46638 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab11bP46638 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab11bP46638 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab11bP46638 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab11bP46638 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab11bP46638 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab11bP46638 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab11bP46638 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab11bP46638 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab11bP46638 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rab11bP46638 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab11bP46638 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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