Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
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