Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rab20P35295 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rab20P35295 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rab20P35295 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rab20P35295 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rab20P35295 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rab20P35295 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rab20P35295 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab20P35295 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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