Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc1P34928 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc1P34928 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc1P34928 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc1P34928 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc1P34928 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc1P34928 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc1P34928 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc1P34928 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc1P34928 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Apoc1P34928 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Apoc1P34928 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms