Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PvalbP32848 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms