Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cd28P31041 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cd28P31041 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cd28P31041 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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