Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxraP28700 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxraP28700 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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