Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atxn10P28658 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atxn10P28658 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atxn10P28658 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atxn10P28658 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atxn10P28658 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atxn10P28658 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atxn10P28658 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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