Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6aP27664 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6aP27664 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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