Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U2af2P26369 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
U2af2P26369 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U2af2P26369 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U2af2P26369 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms