Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nfkb1P25799 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nfkb1P25799 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms