Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ggta1P23336 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ggta1P23336 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms