Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PparaP23204 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PparaP23204 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PparaP23204 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PparaP23204 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PparaP23204 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms