Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms