Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtpraP18052 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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PtpraP18052 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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PtpraP18052 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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PtpraP18052 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtpraP18052 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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PtpraP18052 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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PtpraP18052 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtpraP18052 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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