Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms