Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spi1P17433 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spi1P17433 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms