Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P10404 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P10404 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P10404 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P10404 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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