Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl2P10148 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms