Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Myod1P10085 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms