Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ndufb1P0DN34 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms