Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms