Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Surf1P09925 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf1P09925 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms