Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa5P09021 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms