Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BlmO88700 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BlmO88700 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BlmO88700 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BlmO88700 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BlmO88700 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BlmO88700 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BlmO88700 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BlmO88700 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BlmO88700 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BlmO88700 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BlmO88700 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BlmO88700 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BlmO88700 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BlmO88700 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BlmO88700 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BlmO88700 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BlmO88700 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BlmO88700 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BlmO88700 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms