Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfdp1O88271 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms