Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ldb2O55203 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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